依托环境水质学专业技术平台，中国科学院生态环境研究中心水质分析实验室成立于2010年11月30日，2011年8月26日获得国家认证认可监督管理委员会授予的检验检测机构资质认定证书，2022年2月17日获得中国合格评定国家认可委员会授予的实验室认可资格及国际实验室认可合作组织（ILCA）的能力承认，是专门从事水质分析的检测机构，资质认证证书编号：170013163240，认可证书注册号：CNAS L15994。实验室仪器包括实验室分析仪器以及现场采样和监测设备，代表性仪器设备有超高效液相色谱串联四极杆质谱联用、气相色谱三重四极杆质谱联用仪、电感耦合等离子体质谱仪、低本底αβ测量仪和傅里叶变换显微红外光谱仪等。实验室人员包括博士3名，硕士5名，本科7名，其中高级职称4人，中级职称1人。

截至目前，水质分析实验室的检测能力已经扩展到310项，涵盖了《生活饮用水卫生标准》GB 5749-2006、《地表水环境质量标准》GB3838-2002、《地下水质量标准》GB/T 14848-2017全指标，世界卫生组织颁布的《Guidelines for Drinking water Quality》中109项指标，美国环境保护署颁布的《2018 Edition of the Drinking Water Standards and Health Advisories》（EPA 822-F-18-001）中93项指标，此外还包括《城镇污水处理厂污染物排放标准》GB 18918-2002中30项水质指标检测资质。秉承“管理科学；方法规范；数据准确；服务热情”质量方针，水质分析实验室以精益求精、追求卓越的态度努力成为一流的水质检测分析机构，为社会大众提供公正、可信、权威的检测结果，提供优质的水质分析服务与专业建议。

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